Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC29

NOD2, Nucleotide-binding oligomerization domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOD2Q9HC29 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOD2Q9HC29 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
NOD2Q9HC29 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOD2Q9HC29 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOD2Q9HC29 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
NOD2Q9HC29 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOD2Q9HC29 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOD2Q9HC29 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOD2Q9HC29 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
NOD2Q9HC29 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
NOD2Q9HC29 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
NOD2Q9HC29 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
NOD2Q9HC29 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NOD2Q9HC29 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NOD2Q9HC29 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 8 ms