Protein–RNA interactions for Protein: Q9H9E1

ANKRA2, Ankyrin repeat family A protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 313 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRA2Q9H9E1 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ANKRA2Q9H9E1 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRA2Q9H9E1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRA2Q9H9E1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRA2Q9H9E1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRA2Q9H9E1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ANKRA2Q9H9E1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRA2Q9H9E1 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRA2Q9H9E1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRA2Q9H9E1 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRA2Q9H9E1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ANKRA2Q9H9E1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ANKRA2Q9H9E1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
ANKRA2Q9H9E1 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ANKRA2Q9H9E1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.1 ms