Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZR2

REXO4, RNA exonuclease 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REXO4Q9GZR2 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
REXO4Q9GZR2 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC23.79■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
REXO4Q9GZR2 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
REXO4Q9GZR2 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
REXO4Q9GZR2 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.4 ms