Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYD3

MRPL4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 311 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPL4Q9BYD3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPL4Q9BYD3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPL4Q9BYD3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
MRPL4Q9BYD3 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
MRPL4Q9BYD3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
MRPL4Q9BYD3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
MRPL4Q9BYD3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.95■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
MRPL4Q9BYD3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.3 ms