Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRP4

PAAF1, Proteasomal ATPase-associated factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAAF1Q9BRP4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
PAAF1Q9BRP4 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
PAAF1Q9BRP4 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
PAAF1Q9BRP4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.57■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
PAAF1Q9BRP4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
PAAF1Q9BRP4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms