Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQ90

KLHDC3, Kelch domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHDC3Q9BQ90 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KLHDC3Q9BQ90 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
KLHDC3Q9BQ90 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KLHDC3Q9BQ90 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.1 ms