Protein–RNA interactions for Protein: Q96QD5

DEPDC7, DEP domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEPDC7Q96QD5 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
DEPDC7Q96QD5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC24■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
DEPDC7Q96QD5 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
DEPDC7Q96QD5 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms