Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
PLIN4Q96Q06 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.24
PLIN4Q96Q06 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC29■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.99■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
PLIN4Q96Q06 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
PLIN4Q96Q06 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.5 ms