Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE2

ARHGEF17, Rho guanine nucleotide exchange factor 17, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,063 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGEF17Q96PE2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ARHGEF17Q96PE2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
ARHGEF17Q96PE2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ARHGEF17Q96PE2 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
ARHGEF17Q96PE2 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms