Protein–RNA interactions for Protein: Q96P16

RPRD1A, Regulation of nuclear pre-mRNA domain-containing protein 1A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 312 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1AQ96P16 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
RPRD1AQ96P16 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPRD1AQ96P16 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPRD1AQ96P16 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPRD1AQ96P16 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPRD1AQ96P16 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
RPRD1AQ96P16 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPRD1AQ96P16 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
RPRD1AQ96P16 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
RPRD1AQ96P16 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
RPRD1AQ96P16 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
RPRD1AQ96P16 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
RPRD1AQ96P16 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.5 ms