Protein–RNA interactions for Protein: Q96M34

C3orf30, Uncharacterized protein C3orf30, humanhuman

Predictions only

Length 536 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf30Q96M34 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C3orf30Q96M34 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C3orf30Q96M34 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C3orf30Q96M34 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
C3orf30Q96M34 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
C3orf30Q96M34 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C3orf30Q96M34 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C3orf30Q96M34 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C3orf30Q96M34 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
C3orf30Q96M34 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf30Q96M34 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf30Q96M34 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf30Q96M34 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
C3orf30Q96M34 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf30Q96M34 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
C3orf30Q96M34 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
C3orf30Q96M34 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
C3orf30Q96M34 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf30Q96M34 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
C3orf30Q96M34 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf30Q96M34 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf30Q96M34 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C3orf30Q96M34 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C3orf30Q96M34 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
C3orf30Q96M34 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C3orf30Q96M34 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C3orf30Q96M34 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C3orf30Q96M34 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
C3orf30Q96M34 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms