Protein–RNA interactions for Protein: Q96L08

SUSD3, Sushi domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD3Q96L08 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
SUSD3Q96L08 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
SUSD3Q96L08 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC26.33■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
SUSD3Q96L08 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SUSD3Q96L08 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SUSD3Q96L08 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SUSD3Q96L08 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SUSD3Q96L08 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SUSD3Q96L08 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SUSD3Q96L08 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.8 ms