Protein–RNA interactions for Protein: Q96JS3

PGBD1, PiggyBac transposable element-derived protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 809 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD1Q96JS3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PGBD1Q96JS3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PGBD1Q96JS3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.68■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PGBD1Q96JS3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PGBD1Q96JS3 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.6 ms