Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
LRIG1Q96JA1 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LRIG1Q96JA1 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
LRIG1Q96JA1 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
LRIG1Q96JA1 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms