Protein–RNA interactions for Protein: Q96IY1

NSL1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSL1Q96IY1 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NSL1Q96IY1 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
NSL1Q96IY1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC23.85■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
NSL1Q96IY1 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NSL1Q96IY1 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms