Protein–RNA interactions for Protein: Q96GP6

SCARF2, Scavenger receptor class F member 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 870 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCARF2Q96GP6 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
SCARF2Q96GP6 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
SCARF2Q96GP6 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 COQ2-201ENST00000311461 1464 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
SCARF2Q96GP6 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARF2Q96GP6 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARF2Q96GP6 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARF2Q96GP6 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARF2Q96GP6 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARF2Q96GP6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
SCARF2Q96GP6 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF2Q96GP6 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF2Q96GP6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
SCARF2Q96GP6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARF2Q96GP6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
SCARF2Q96GP6 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms