Protein–RNA interactions for Protein: Q96FM1

PGAP3, Post-GPI attachment to proteins factor 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 320 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGAP3Q96FM1 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGAP3Q96FM1 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
PGAP3Q96FM1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGAP3Q96FM1 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGAP3Q96FM1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGAP3Q96FM1 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
PGAP3Q96FM1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGAP3Q96FM1 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGAP3Q96FM1 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
PGAP3Q96FM1 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
PGAP3Q96FM1 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PGAP3Q96FM1 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PGAP3Q96FM1 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
PGAP3Q96FM1 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 227.9 ms