Protein–RNA interactions for Protein: Q96EM0

L3HYPDH, Trans-3-hydroxy-L-proline dehydratase, humanhuman

Predictions only

Length 354 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L3HYPDHQ96EM0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
L3HYPDHQ96EM0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
L3HYPDHQ96EM0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
L3HYPDHQ96EM0 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
L3HYPDHQ96EM0 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.3 ms