Protein–RNA interactions for Protein: Q93100

PHKB, Phosphorylase b kinase regulatory subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHKBQ93100 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
PHKBQ93100 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.77■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.76■■■□□ 2.2
PHKBQ93100 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
PHKBQ93100 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PHKBQ93100 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
PHKBQ93100 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHKBQ93100 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHKBQ93100 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHKBQ93100 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PHKBQ93100 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHKBQ93100 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHKBQ93100 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.62■■■□□ 2.17
PHKBQ93100 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHKBQ93100 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PHKBQ93100 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.61■■■□□ 2.17
PHKBQ93100 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 94.4 ms