Protein–RNA interactions for Protein: Q92759

GTF2H4, General transcription factor IIH subunit 4, humanhuman

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2H4Q92759 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GTF2H4Q92759 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GTF2H4Q92759 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GTF2H4Q92759 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GTF2H4Q92759 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms