Protein–RNA interactions for Protein: Q92484

SMPDL3A, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3a, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMPDL3AQ92484 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
SMPDL3AQ92484 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SMPDL3AQ92484 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
SMPDL3AQ92484 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPDL3AQ92484 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPDL3AQ92484 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
SMPDL3AQ92484 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPDL3AQ92484 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPDL3AQ92484 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPDL3AQ92484 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SMPDL3AQ92484 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPDL3AQ92484 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
SMPDL3AQ92484 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms