Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC51

SERBP1, Plasminogen activator inhibitor 1 RNA-binding protein, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 408 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SERBP1Q8NC51 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.592e-9■■■■■ 34.5
SERBP1Q8NC51 ASXL1-202ENST00000375687 7031 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.463e-9■■■■■ 34.3
SERBP1Q8NC51 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.383e-9■■■■■ 34.3
SERBP1Q8NC51 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.193e-9■■■■■ 34.3
SERBP1Q8NC51 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.183e-9■■■■■ 34.3
SERBP1Q8NC51 PTP4A2-212ENST00000529477 568 ntTSL 318.52■□□□□ 0.569e-10■■■■■ 34.2
SERBP1Q8NC51 PTP4A2-209ENST00000526960 793 ntTSL 513.64□□□□□ -0.239e-10■■■■■ 34.2
SERBP1Q8NC51 PTP4A2-202ENST00000468531 830 ntTSL 38.02□□□□□ -1.139e-10■■■■■ 34.2
SERBP1Q8NC51 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.733e-7■■■■■ 34.2
SERBP1Q8NC51 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.643e-7■■■■■ 34.2
SERBP1Q8NC51 PTMS-206ENST00000540874 501 ntTSL 217.93■□□□□ 0.463e-7■■■■■ 34.2
SERBP1Q8NC51 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.163e-7■■■■■ 34.2
SERBP1Q8NC51 PTMS-204ENST00000540667 820 ntTSL 213.94□□□□□ -0.183e-7■■■■■ 34.2
SERBP1Q8NC51 PABPC4-207ENST00000451091 898 ntTSL 322.96■■□□□ 1.272e-6■■■■■ 34.1
SERBP1Q8NC51 PABPC4-225ENST00000531243 532 ntTSL 421.09■□□□□ 0.972e-6■■■■■ 34.1
SERBP1Q8NC51 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.172e-6■■■■■ 34.1
SERBP1Q8NC51 PABPC4-202ENST00000372857 3048 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 34.1
SERBP1Q8NC51 FKBP8-206ENST00000596558 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.67e-8■■■■■ 34
SERBP1Q8NC51 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.167e-8■■■■■ 34
SERBP1Q8NC51 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC13.41□□□□□ -0.265e-14■■■■■ 33.9
SERBP1Q8NC51 SNORD3D-202ENST00000630092 217 ntBASIC11.1□□□□□ -0.635e-14■■■■■ 33.9
SERBP1Q8NC51 SNORD3D-201ENST00000619178 218 ntBASIC11.05□□□□□ -0.645e-14■■■■■ 33.9
SERBP1Q8NC51 LMNA-211ENST00000470199 551 ntTSL 417.47■□□□□ 0.397e-8■■■■■ 33.6
SERBP1Q8NC51 LMNA-219ENST00000502751 570 ntTSL 415.96■□□□□ 0.157e-8■■■■■ 33.6
SERBP1Q8NC51 LMNA-210ENST00000469565 591 ntTSL 413.52□□□□□ -0.257e-8■■■■■ 33.6
SERBP1Q8NC51 LMNA-214ENST00000478063 285 ntTSL 513.37□□□□□ -0.277e-8■■■■■ 33.6
SERBP1Q8NC51 FKBP8-208ENST00000597611 966 ntTSL 314.89□□□□□ -0.037e-8■■■■■ 33.6
SERBP1Q8NC51 GSPT1-202ENST00000434724 7105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.162e-6■■■■■ 33.5
SERBP1Q8NC51 GSPT1-201ENST00000420576 1603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.22□□□□□ -0.932e-6■■■■■ 33.5
SERBP1Q8NC51 ANKRD9-203ENST00000559404 1502 ntTSL 225.08■■□□□ 1.612e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.572e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.362e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 UBE2S-202ENST00000587845 743 ntTSL 222.75■■□□□ 1.232e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 FARSA-203ENST00000586146 1707 ntTSL 521.79■■□□□ 1.082e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 FARSA-201ENST00000314606 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.012e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 FARSA-208ENST00000588965 1831 ntTSL 519.97■□□□□ 0.792e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.732e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.632e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.622e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.614e-6■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 FARSA-209ENST00000592662 864 ntTSL 1 (best)18.38■□□□□ 0.532e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 FARSA-210ENST00000593021 1135 ntTSL 518.05■□□□□ 0.482e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.414e-6■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 SCRIB-203ENST00000377533 5108 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.414e-6■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 FARSA-206ENST00000587981 521 ntTSL 217.16■□□□□ 0.342e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.32e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.132e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.042e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 HIC2-203ENST00000443632 6940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.76□□□□□ -0.212e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 LARP1-206ENST00000518677 827 ntTSL 513.28□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 FARSA-204ENST00000586280 803 ntTSL 313.16□□□□□ -0.32e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 HCFC1-202ENST00000369984 8375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.79□□□□□ -0.362e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 PLEC-208ENST00000436759 14787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.442e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 PLEC-202ENST00000345136 14803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.27□□□□□ -0.452e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 PLEC-201ENST00000322810 15249 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.03□□□□□ -0.482e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 HCFC1-203ENST00000444191 3624 ntTSL 511.91□□□□□ -0.52e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 PLEC-210ENST00000527096 13713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.7□□□□□ -0.542e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 LARP1-212ENST00000522272 467 ntTSL 311.53□□□□□ -0.562e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 PLEC-204ENST00000354958 14751 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.62e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 PLEC-203ENST00000354589 14736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.15□□□□□ -0.622e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 PLEC-206ENST00000357649 14689 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.632e-7■■■■■ 33.4
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SERBP1Q8NC51 PLEC-207ENST00000398774 14646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.722e-7■■■■■ 33.4
SERBP1Q8NC51 PTP4A2-215ENST00000533408 376 ntTSL 321.02■□□□□ 0.961e-11■■■■■ 33.1
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SERBP1Q8NC51 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.156e-7■■■■■ 32.8
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SERBP1Q8NC51 ABL1-202ENST00000372348 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.461e-6■■■■■ 32.8
SERBP1Q8NC51 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.476e-8■■■■■ 32.6
SERBP1Q8NC51 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.326e-8■■■■■ 32.6
SERBP1Q8NC51 FKBP8-211ENST00000601844 1548 ntTSL 517.11■□□□□ 0.336e-8■■■■■ 32.6
SERBP1Q8NC51 FKBP8-202ENST00000544835 1292 ntTSL 1 (best)16.81■□□□□ 0.286e-8■■■■■ 32.6
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SERBP1Q8NC51 TPT1-205ENST00000442760 902 ntTSL 218.89■□□□□ 0.611e-13■■■■■ 32.5
SERBP1Q8NC51 TPT1-208ENST00000527226 613 ntTSL 214.4□□□□□ -0.11e-13■■■■■ 32.5
SERBP1Q8NC51 TPT1-212ENST00000530705 4735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.26□□□□□ -0.451e-13■■■■■ 32.5
SERBP1Q8NC51 TPT1-203ENST00000379056 1101 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.551e-13■■■■■ 32.5
SERBP1Q8NC51 TPT1-214ENST00000616577 4814 ntTSL 3 BASIC10.79□□□□□ -0.681e-13■■■■■ 32.5
SERBP1Q8NC51 TPT1-207ENST00000490277 1851 ntTSL 28.51□□□□□ -1.051e-13■■■■■ 32.5
SERBP1Q8NC51 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.188e-7■■■■■ 32.4
SERBP1Q8NC51 SF3A2-206ENST00000592314 885 ntTSL 513.82□□□□□ -0.28e-7■■■■■ 32.4
SERBP1Q8NC51 FERMT3-201ENST00000279227 2489 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 32.3
SERBP1Q8NC51 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.073e-6■■■■■ 32.3
SERBP1Q8NC51 EIF1-204ENST00000469308 815 ntTSL 221.87■■□□□ 1.092e-33■■■■■ 32.3
SERBP1Q8NC51 EIF1-202ENST00000462917 2170 ntTSL 1 (best)18.91■□□□□ 0.622e-33■■■■■ 32.3
SERBP1Q8NC51 EIF1-201ENST00000310837 1120 ntTSL 1 (best)8.51□□□□□ -1.052e-33■■■■■ 32.3
SERBP1Q8NC51 EIF1-203ENST00000469257 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.51□□□□□ -1.212e-33■■■■■ 32.3
SERBP1Q8NC51 EIF1-207ENST00000591776 797 ntTSL 4 BASIC7.24□□□□□ -1.252e-33■■■■■ 32.3
SERBP1Q8NC51 EIF1-205ENST00000482111 1428 ntTSL 26.58□□□□□ -1.362e-33■■■■■ 32.3
SERBP1Q8NC51 TRIM28-213ENST00000598355 714 ntTSL 215.67■□□□□ 0.13e-8■■■■■ 32
SERBP1Q8NC51 HSPA5-201ENST00000324460 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.41□□□□□ -0.745e-8■■■■■ 32
SERBP1Q8NC51 SF1-210ENST00000443908 767 ntTSL 313.48□□□□□ -0.253e-7■■■■■ 31.8
SERBP1Q8NC51 HSPB1-203ENST00000447574 1455 ntTSL 1 (best)19.87■□□□□ 0.771e-6■■■■■ 31.7
SERBP1Q8NC51 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.181e-6■■■■■ 31.7
SERBP1Q8NC51 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.772e-6■■■■■ 31.6
SERBP1Q8NC51 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.222e-6■■■■■ 31.6
SERBP1Q8NC51 MZT2B-203ENST00000425361 455 ntAPPRIS ALT2 TSL 215.87■□□□□ 0.132e-6■■■■■ 31.6
SERBP1Q8NC51 MZT2B-205ENST00000457492 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 513.73□□□□□ -0.212e-6■■■■■ 31.6
SERBP1Q8NC51 PKM-212ENST00000564440 3016 ntTSL 1 (best)9.14□□□□□ -0.955e-8■■■■■ 31.5
SERBP1Q8NC51 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.842e-6■■■■■ 31.4
Retrieved 100 of 2,723 protein–RNA pairs in 137.4 ms