Protein–RNA interactions for Protein: Q8N998

CCDC89, Coiled-coil domain-containing protein 89, humanhuman

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC89Q8N998 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CCDC89Q8N998 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CCDC89Q8N998 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CCDC89Q8N998 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CCDC89Q8N998 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 137.4 ms