Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6J9

TSEN54, tRNA-splicing endonuclease subunit Sen54, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 526 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSEN54Q7Z6J9 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSEN54Q7Z6J9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSEN54Q7Z6J9 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
TSEN54Q7Z6J9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
TSEN54Q7Z6J9 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms