Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z6E9

RBBP6, E3 ubiquitin-protein ligase RBBP6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,792 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP6Q7Z6E9 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC28.87■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
RBBP6Q7Z6E9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 NBPF26-209ENST00000624419 1133 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
RBBP6Q7Z6E9 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.75■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC28.73■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC28.73■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC28.71■■■□□ 2.19
RBBP6Q7Z6E9 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
RBBP6Q7Z6E9 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms