Protein–RNA interactions for Protein: Q7LC44

ARC, Activity-regulated cytoskeleton-associated protein, humanhuman

Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARCQ7LC44 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
ARCQ7LC44 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
ARCQ7LC44 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
ARCQ7LC44 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 TMEM150A-201ENST00000306353 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
ARCQ7LC44 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms