Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
CCDC171Q6TFL3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
CCDC171Q6TFL3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC29.81■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.8■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.79■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
CCDC171Q6TFL3 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC29.76■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
CCDC171Q6TFL3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.69■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC29.68■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
CCDC171Q6TFL3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms