Protein–RNA interactions for Protein: Q6P2S7

TTC41P, Putative tetratricopeptide repeat protein 41, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC41PQ6P2S7 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.33■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TTC41PQ6P2S7 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.32■■■□□ 2.44
TTC41PQ6P2S7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TTC41PQ6P2S7 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC30.31■■■□□ 2.44
TTC41PQ6P2S7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
TTC41PQ6P2S7 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TTC41PQ6P2S7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
TTC41PQ6P2S7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TTC41PQ6P2S7 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
TTC41PQ6P2S7 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.28■■■□□ 2.44
TTC41PQ6P2S7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TTC41PQ6P2S7 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC30.27■■■□□ 2.44
TTC41PQ6P2S7 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC30.27■■■□□ 2.44
TTC41PQ6P2S7 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
TTC41PQ6P2S7 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TTC41PQ6P2S7 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TTC41PQ6P2S7 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.44
TTC41PQ6P2S7 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
TTC41PQ6P2S7 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.17■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC30.16■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
TTC41PQ6P2S7 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.14■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC30.08■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
TTC41PQ6P2S7 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
TTC41PQ6P2S7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.9 ms