Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1S2

C3orf33, Protein C3orf33, humanhuman

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C3orf33Q6P1S2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
C3orf33Q6P1S2 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
C3orf33Q6P1S2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
C3orf33Q6P1S2 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
C3orf33Q6P1S2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms