Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
LETMD1Q6P1Q0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.85■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
LETMD1Q6P1Q0 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC23.83■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
LETMD1Q6P1Q0 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 79.5 ms