Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSW5

FAM45BP, Putative protein FAM45B, humanhuman

Predictions only

Length 357 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM45BPQ6NSW5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FAM45BPQ6NSW5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM45BPQ6NSW5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM45BPQ6NSW5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM45BPQ6NSW5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM45BPQ6NSW5 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
FAM45BPQ6NSW5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
FAM45BPQ6NSW5 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
FAM45BPQ6NSW5 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM45BPQ6NSW5 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM45BPQ6NSW5 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM45BPQ6NSW5 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
FAM45BPQ6NSW5 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM45BPQ6NSW5 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM45BPQ6NSW5 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM45BPQ6NSW5 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM45BPQ6NSW5 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
FAM45BPQ6NSW5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM45BPQ6NSW5 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
FAM45BPQ6NSW5 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM45BPQ6NSW5 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM45BPQ6NSW5 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM45BPQ6NSW5 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
FAM45BPQ6NSW5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
FAM45BPQ6NSW5 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.5 ms