Protein–RNA interactions for Protein: Q6NSJ2

PHLDB3, Pleckstrin homology-like domain family B member 3, humanhuman

Predictions only

Length 640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHLDB3Q6NSJ2 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PHLDB3Q6NSJ2 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
PHLDB3Q6NSJ2 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.85■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.83■■□□□ 1.89
PHLDB3Q6NSJ2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC26.82■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PHLDB3Q6NSJ2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PHLDB3Q6NSJ2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 112.4 ms