Protein–RNA interactions for Protein: Q5T2W1

PDZK1, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF3, humanhuman

Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZK1Q5T2W1 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
PDZK1Q5T2W1 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
PDZK1Q5T2W1 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
PDZK1Q5T2W1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
PDZK1Q5T2W1 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.3 ms