Protein–RNA interactions for Protein: Q5QFB9

PAPPA-AS1, Protein PAPPAS, humanhuman

Predictions only

Length 102 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PAPPA-AS1Q5QFB9 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
PAPPA-AS1Q5QFB9 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
PAPPA-AS1Q5QFB9 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms