Protein–RNA interactions for Protein: Q53H54

TRMT12, tRNA wybutosine-synthesizing protein 2 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 448 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRMT12Q53H54 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT12Q53H54 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT12Q53H54 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT12Q53H54 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT12Q53H54 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT12Q53H54 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT12Q53H54 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT12Q53H54 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TRMT12Q53H54 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT12Q53H54 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT12Q53H54 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
TRMT12Q53H54 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRMT12Q53H54 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
TRMT12Q53H54 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
TRMT12Q53H54 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
TRMT12Q53H54 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
TRMT12Q53H54 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms