Protein–RNA interactions for Protein: Q52LW3

ARHGAP29, Rho GTPase-activating protein 29, humanhuman

Predictions only

Length 1,261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARHGAP29Q52LW3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ARHGAP29Q52LW3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ARHGAP29Q52LW3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ARHGAP29Q52LW3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC27■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ARHGAP29Q52LW3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms