Protein–RNA interactions for Protein: Q3BBV2

NBPF8, Putative neuroblastoma breakpoint family member 8, humanhuman

Predictions only

Length 869 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF8Q3BBV2 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.52■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.28
NBPF8Q3BBV2 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC35.51■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC35.51■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC35.5■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC35.49■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.49■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC35.48■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC35.48■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC35.47■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC35.47■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC35.46■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.46■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.45■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.45■■■■□ 3.27
NBPF8Q3BBV2 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NBPF8Q3BBV2 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC35.44■■■■□ 3.26
NBPF8Q3BBV2 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NBPF8Q3BBV2 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.44■■■■□ 3.26
NBPF8Q3BBV2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NBPF8Q3BBV2 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.43■■■■□ 3.26
NBPF8Q3BBV2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NBPF8Q3BBV2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.42■■■■□ 3.26
NBPF8Q3BBV2 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC35.41■■■■□ 3.26
NBPF8Q3BBV2 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NBPF8Q3BBV2 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC35.4■■■■□ 3.26
NBPF8Q3BBV2 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NBPF8Q3BBV2 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.4■■■■□ 3.26
NBPF8Q3BBV2 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC35.4■■■■□ 3.26
NBPF8Q3BBV2 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NBPF8Q3BBV2 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC35.39■■■■□ 3.26
NBPF8Q3BBV2 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC35.38■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC35.38■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC35.38■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.37■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.37■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.36■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC35.35■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC35.35■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.34■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.34■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC35.33■■■■□ 3.25
NBPF8Q3BBV2 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.32■■■■□ 3.24
NBPF8Q3BBV2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.32■■■■□ 3.24
NBPF8Q3BBV2 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NBPF8Q3BBV2 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.31■■■■□ 3.24
NBPF8Q3BBV2 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC35.31■■■■□ 3.24
NBPF8Q3BBV2 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NBPF8Q3BBV2 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC35.3■■■■□ 3.24
NBPF8Q3BBV2 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC35.3■■■■□ 3.24
NBPF8Q3BBV2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.3■■■■□ 3.24
NBPF8Q3BBV2 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC35.29■■■■□ 3.24
NBPF8Q3BBV2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC35.29■■■■□ 3.24
NBPF8Q3BBV2 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NBPF8Q3BBV2 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.28■■■■□ 3.24
NBPF8Q3BBV2 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC35.27■■■■□ 3.24
NBPF8Q3BBV2 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NBPF8Q3BBV2 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.24
NBPF8Q3BBV2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.26■■■■□ 3.24
NBPF8Q3BBV2 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC35.26■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC35.25■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC35.25■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC35.25■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.24■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC35.24■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.23■■■■□ 3.23
NBPF8Q3BBV2 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.22■■■■□ 3.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms