Protein–RNA interactions for Protein: Q16630

CPSF6, Cleavage and polyadenylation specificity factor subunit 6, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 551 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPSF6Q16630 HNRNPC-232ENST00000557442 1308 ntTSL 210.03□□□□□ -0.83e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 SAP30BP-203ENST00000542343 1011 ntTSL 29.93□□□□□ -0.823e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-230ENST00000557201 1371 ntTSL 1 (best) BASIC9.88□□□□□ -0.833e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-213ENST00000554891 644 ntTSL 59.85□□□□□ -0.833e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-225ENST00000556513 1403 ntTSL 5 BASIC9.7□□□□□ -0.863e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-208ENST00000553753 1790 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.883e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-219ENST00000555309 1714 ntTSL 5 BASIC9.42□□□□□ -0.93e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-218ENST00000555215 781 ntTSL 59.23□□□□□ -0.933e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-209ENST00000554383 1039 ntTSL 59.23□□□□□ -0.933e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-223ENST00000556142 1599 ntTSL 5 BASIC9.18□□□□□ -0.943e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-224ENST00000556226 629 ntTSL 59.08□□□□□ -0.963e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 SBNO1-203ENST00000602398 4313 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.07□□□□□ -0.963e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 SAP30BP-208ENST00000578909 678 ntTSL 58.98□□□□□ -0.973e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-216ENST00000555137 789 ntTSL 38.77□□□□□ -1.013e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-201ENST00000336053 3301 ntTSL 2 BASIC8.56□□□□□ -1.043e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 PRELID2-206ENST00000510594 552 ntTSL 38.41□□□□□ -1.063e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-222ENST00000555914 1658 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.073e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-207ENST00000553614 604 ntTSL 58.17□□□□□ -1.13e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-227ENST00000556897 1252 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.17□□□□□ -1.13e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 PRELID2-208ENST00000515161 419 ntTSL 38□□□□□ -1.133e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-212ENST00000554539 748 ntTSL 57.67□□□□□ -1.183e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 PRELID2-205ENST00000510259 525 ntTSL 37.55□□□□□ -1.23e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 SAP30BP-206ENST00000578354 574 ntTSL 47.48□□□□□ -1.213e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC7.45□□□□□ -1.223e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-211ENST00000554455 1784 ntTSL 1 (best) BASIC7.41□□□□□ -1.223e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC7.21□□□□□ -1.263e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-226ENST00000556628 1156 ntTSL 1 (best) BASIC7.14□□□□□ -1.273e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-233ENST00000557768 599 ntTSL 37.03□□□□□ -1.283e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 SAP30BP-210ENST00000579864 868 ntTSL 36.62□□□□□ -1.353e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 SBNO1-201ENST00000267176 11121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.36□□□□□ -1.393e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 SBNO1-202ENST00000420886 10981 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC6.24□□□□□ -1.413e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-217ENST00000555176 531 ntTSL 53.35□□□□□ -1.873e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.33□□□□□ -1.883e-7■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.474e-6■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.14e-6■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 SMC4-202ENST00000357388 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.374e-6■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 SMC4-210ENST00000469762 3998 ntTSL 2 BASIC9.99□□□□□ -0.814e-6■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 SMC4-203ENST00000462668 4235 ntTSL 23.6□□□□□ -1.834e-6■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 ZNF326-204ENST00000394583 1956 ntTSL 1 (best)18.11■□□□□ 0.493e-9■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 ZNF326-201ENST00000340281 2729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.533e-9■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 ZNF326-203ENST00000370447 9433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.12□□□□□ -1.273e-9■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 ZC3H15-206ENST00000477672 304 ntTSL 311.73□□□□□ -0.533e-8■■■□□ 15.6
CPSF6Q16630 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.034e-6■■■□□ 15.5
CPSF6Q16630 PPP1R12C-209ENST00000592993 2269 ntTSL 1 (best)20.34■□□□□ 0.854e-6■■■□□ 15.5
CPSF6Q16630 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.574e-6■■■□□ 15.5
CPSF6Q16630 ISYNA1-204ENST00000577916 2148 ntTSL 523.8■■□□□ 1.45e-6■■■□□ 15.5
CPSF6Q16630 ISYNA1-211ENST00000582811 2039 ntTSL 221.07■□□□□ 0.965e-6■■■□□ 15.5
CPSF6Q16630 ISYNA1-201ENST00000338128 2420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.765e-6■■■□□ 15.5
CPSF6Q16630 ISYNA1-213ENST00000583534 629 ntTSL 1 (best)19.07■□□□□ 0.645e-6■■■□□ 15.5
CPSF6Q16630 ISYNA1-205ENST00000578352 592 ntTSL 217.34■□□□□ 0.375e-6■■■□□ 15.5
CPSF6Q16630 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.315e-6■■■□□ 15.5
CPSF6Q16630 ISYNA1-210ENST00000582770 1654 ntTSL 216.79■□□□□ 0.285e-6■■■□□ 15.5
CPSF6Q16630 ISYNA1-208ENST00000581800 627 ntTSL 414.64□□□□□ -0.075e-6■■■□□ 15.5
CPSF6Q16630 ISYNA1-203ENST00000577820 1466 ntTSL 513.65□□□□□ -0.225e-6■■■□□ 15.5
CPSF6Q16630 RBM33-203ENST00000341148 7058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.35□□□□□ -0.432e-10■■■□□ 15.4
CPSF6Q16630 RBM33-207ENST00000401878 10149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.552e-10■■■□□ 15.4
CPSF6Q16630 LAS1L-202ENST00000374807 2386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.33□□□□□ -0.282e-9■■■□□ 15.4
CPSF6Q16630 LAS1L-201ENST00000374804 2261 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.332e-9■■■□□ 15.4
CPSF6Q16630 LAS1L-205ENST00000484069 5205 ntTSL 212.96□□□□□ -0.332e-9■■■□□ 15.4
CPSF6Q16630 LAS1L-203ENST00000374811 2439 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.532e-9■■■□□ 15.4
CPSF6Q16630 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.667e-8■■■□□ 15.3
CPSF6Q16630 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.557e-8■■■□□ 15.3
CPSF6Q16630 USP48-213ENST00000529637 3228 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.217e-8■■■□□ 15.3
CPSF6Q16630 USP48-203ENST00000374732 3037 ntTSL 2 BASIC7.09□□□□□ -1.277e-8■■■□□ 15.3
CPSF6Q16630 ZC3H15-203ENST00000437396 556 ntTSL 410.51□□□□□ -0.736e-8■■■□□ 15.3
CPSF6Q16630 TFRC-201ENST00000360110 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.972e-6■■■□□ 15.2
CPSF6Q16630 TFRC-203ENST00000420415 4814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.61□□□□□ -1.192e-6■■■□□ 15.2
CPSF6Q16630 ANP32A-207ENST00000486054 2015 ntTSL 216.58■□□□□ 0.241e-17■■■□□ 15.2
CPSF6Q16630 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.031e-17■■■□□ 15.2
CPSF6Q16630 ANP32A-201ENST00000267918 1084 ntTSL 314.12□□□□□ -0.151e-17■■■□□ 15.2
CPSF6Q16630 ANP32A-202ENST00000409628 2001 ntTSL 513.62□□□□□ -0.231e-17■■■□□ 15.2
CPSF6Q16630 ANP32A-206ENST00000483551 3711 ntTSL 58.91□□□□□ -0.981e-17■■■□□ 15.2
CPSF6Q16630 DNAJC2-205ENST00000426036 729 ntTSL 56.43□□□□□ -1.386e-7■■■□□ 15.2
CPSF6Q16630 SON-210ENST00000465834 957 ntTSL 37.15□□□□□ -1.264e-7■■■□□ 15.1
CPSF6Q16630 ZBED9-204ENST00000530247 755 ntTSL 211.08□□□□□ -0.643e-6■■■□□ 15.1
CPSF6Q16630 WRN-201ENST00000298139 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.31□□□□□ -1.882e-7■■■□□ 15.1
CPSF6Q16630 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.693e-7■■■□□ 15
CPSF6Q16630 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.13e-7■■■□□ 15
CPSF6Q16630 HNRNPA3-202ENST00000411529 5688 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.793e-7■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC19.3■□□□□ 0.686e-7■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.485e-10■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZFPL1-206ENST00000526440 784 ntTSL 517.51■□□□□ 0.396e-7■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZFPL1-205ENST00000526334 692 ntTSL 315.94■□□□□ 0.146e-7■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZFPL1-214ENST00000533216 1146 ntTSL 1 (best)15.94■□□□□ 0.146e-7■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZFPL1-204ENST00000526289 980 ntTSL 215.38■□□□□ 0.056e-7■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZFPL1-202ENST00000453524 718 ntTSL 515.26■□□□□ 0.036e-7■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.036e-7■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.055e-10■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.055e-10■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.186e-7■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.235e-10■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZCCHC17-201ENST00000344147 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.255e-10■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.285e-10■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.285e-10■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZFPL1-212ENST00000531761 518 ntTSL 512.39□□□□□ -0.436e-7■■■□□ 15
CPSF6Q16630 DLC1-201ENST00000276297 7447 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.77□□□□□ -16e-7■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZCCHC17-209ENST00000627541 1158 ntTSL 5 BASIC7.71□□□□□ -1.185e-10■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZFPL1-208ENST00000526945 576 ntTSL 37.68□□□□□ -1.186e-7■■■□□ 15
CPSF6Q16630 ZFPL1-213ENST00000532200 802 ntTSL 27.15□□□□□ -1.266e-7■■■□□ 15
CPSF6Q16630 RBM28-204ENST00000478061 932 ntTSL 312.16□□□□□ -0.468e-9■■■□□ 14.9
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