Protein–RNA interactions for Protein: Q15323

KRT31, Keratin, type I cuticular Ha1, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT31Q15323 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
KRT31Q15323 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
KRT31Q15323 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
KRT31Q15323 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
KRT31Q15323 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
KRT31Q15323 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 98.4 ms