Protein–RNA interactions for Protein: Q15286

RAB35, Ras-related protein Rab-35, humanhuman

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB35Q15286 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
RAB35Q15286 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC21.74■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
RAB35Q15286 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
RAB35Q15286 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
RAB35Q15286 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
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