Protein–RNA interactions for Protein: Q13242

SRSF9, Serine/arginine-rich splicing factor 9, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 221 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF9Q13242 HDAC4-204ENST00000446876 554 ntTSL 49.1□□□□□ -0.957e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 HDAC4-210ENST00000493582 3188 ntTSL 1 (best)9.08□□□□□ -0.967e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TBCD-225ENST00000576996 827 ntTSL 59.01□□□□□ -0.977e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 MAEA-217ENST00000512842 550 ntTSL 48.8□□□□□ -17e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 MAEA-207ENST00000505177 1340 ntTSL 5 BASIC8.5□□□□□ -1.057e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TBCD-214ENST00000574801 586 ntTSL 48.2□□□□□ -1.17e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TJAP1-215ENST00000612912 4312 ntTSL 2 BASIC8.03□□□□□ -1.127e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 MAEA-205ENST00000503653 845 ntTSL 37.96□□□□□ -1.147e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TJAP1-213ENST00000483640 3468 ntTSL 57.68□□□□□ -1.187e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TJAP1-210ENST00000454762 3268 ntTSL 1 (best)7.6□□□□□ -1.197e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TBCD-224ENST00000576760 1059 ntTSL 57.43□□□□□ -1.227e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TBCD-206ENST00000571712 850 ntTSL 56.82□□□□□ -1.327e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TBCD-211ENST00000572984 682 ntTSL 56.66□□□□□ -1.347e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TBCD-219ENST00000576160 942 ntTSL 56.38□□□□□ -1.397e-6■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TNRC6A-202ENST00000395799 8438 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC6.91□□□□□ -1.32e-8■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TNRC6A-201ENST00000315183 8303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC6.75□□□□□ -1.332e-8■■■■□ 20
SRSF9Q13242 TNRC6A-207ENST00000491718 7956 ntTSL 1 (best)5.53□□□□□ -1.522e-8■■■■□ 20
SRSF9Q13242 CA5A-201ENST00000309893 7567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.46□□□□□ -1.062e-6■■■■□ 19.9
SRSF9Q13242 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.382e-7■■■■□ 19.9
SRSF9Q13242 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.392e-6■■■■□ 19.8
SRSF9Q13242 RPS18-236ENST00000490191 996 ntTSL 29.92□□□□□ -0.828e-7■■■■□ 19.7
SRSF9Q13242 RPS18-234ENST00000476222 685 ntTSL 1 (best)7.23□□□□□ -1.258e-7■■■■□ 19.7
SRSF9Q13242 RPS18-233ENST00000474973 589 ntTSL 2 BASIC7.23□□□□□ -1.258e-7■■■■□ 19.7
SRSF9Q13242 RPS18-230ENST00000439602 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.23□□□□□ -1.258e-7■■■■□ 19.7
SRSF9Q13242 RPS18-232ENST00000474626 639 ntTSL 36.45□□□□□ -1.388e-7■■■■□ 19.7
SRSF9Q13242 RPS18-237ENST00000496813 642 ntTSL 26.45□□□□□ -1.388e-7■■■■□ 19.7
SRSF9Q13242 PRODH2-206ENST00000591694 728 ntTSL 310.71□□□□□ -0.694e-6■■■■□ 19.7
SRSF9Q13242 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.594e-6■■■■□ 19.6
SRSF9Q13242 CALD1-222ENST00000495522 2199 ntTSL 5 BASIC11.17□□□□□ -0.624e-6■■■■□ 19.6
SRSF9Q13242 CALD1-206ENST00000424922 2124 ntTSL 1 (best) BASIC10.56□□□□□ -0.724e-6■■■■□ 19.6
SRSF9Q13242 CALD1-209ENST00000436461 1614 ntTSL 510.51□□□□□ -0.734e-6■■■■□ 19.6
SRSF9Q13242 CALD1-205ENST00000422748 2665 ntTSL 2 BASIC10.25□□□□□ -0.774e-6■■■■□ 19.6
SRSF9Q13242 CALD1-207ENST00000430085 1938 ntTSL 29.89□□□□□ -0.834e-6■■■■□ 19.6
SRSF9Q13242 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.68□□□□□ -0.862e-13■■■■□ 19.6
SRSF9Q13242 HMGB2-205ENST00000511316 1841 ntTSL 29.64□□□□□ -0.872e-13■■■■□ 19.6
SRSF9Q13242 CALD1-203ENST00000393118 4281 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.074e-6■■■■□ 19.6
SRSF9Q13242 HMGB2-201ENST00000296503 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.22□□□□□ -1.092e-13■■■■□ 19.6
SRSF9Q13242 CALD1-210ENST00000443197 4173 ntTSL 58.13□□□□□ -1.114e-6■■■■□ 19.6
SRSF9Q13242 CALD1-201ENST00000361675 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.48□□□□□ -1.214e-6■■■■□ 19.6
SRSF9Q13242 CALD1-202ENST00000361901 4114 ntTSL 1 (best) BASIC7.29□□□□□ -1.244e-6■■■■□ 19.6
SRSF9Q13242 CALD1-220ENST00000482470 3941 ntTSL 27.09□□□□□ -1.274e-6■■■■□ 19.6
SRSF9Q13242 HMGB2-202ENST00000438704 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.13□□□□□ -1.592e-13■■■■□ 19.6
SRSF9Q13242 MGAT5-203ENST00000468758 816 ntTSL 515.3■□□□□ 0.042e-7■■■■□ 19.6
SRSF9Q13242 MGAT5-204ENST00000481801 651 ntTSL 315.3■□□□□ 0.042e-7■■■■□ 19.6
SRSF9Q13242 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.557e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 NISCH-201ENST00000345716 5238 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.347e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 NISCH-213ENST00000489895 5350 ntTSL 214.28□□□□□ -0.127e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC12.44□□□□□ -0.427e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.36□□□□□ -0.437e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.2□□□□□ -0.467e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 NISCH-209ENST00000485765 563 ntTSL 411.77□□□□□ -0.537e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 NISCH-202ENST00000420808 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.39□□□□□ -0.597e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.67e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 NISCH-207ENST00000479054 5173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.27□□□□□ -0.617e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.627e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.667e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 ASPH-214ENST00000519234 2874 ntTSL 5 BASIC10.76□□□□□ -0.697e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 NISCH-212ENST00000488380 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.47□□□□□ -0.737e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 PDXK-204ENST00000398078 1069 ntTSL 210.33□□□□□ -0.761e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 ASPH-203ENST00000379454 5268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.17□□□□□ -0.787e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 AP1G2-231ENST00000557189 678 ntTSL 210.06□□□□□ -0.87e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 VPS54-203ENST00000409558 4337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10□□□□□ -0.817e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 OSMR-AS1-203ENST00000513480 583 ntTSL 49.94□□□□□ -0.827e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 ASPH-208ENST00000517856 6337 ntTSL 2 BASIC9.93□□□□□ -0.827e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 PIGG-208ENST00000504346 3019 ntTSL 2 BASIC9.88□□□□□ -0.837e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 PIGG-219ENST00000511247 746 ntTSL 39.81□□□□□ -0.847e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 SDF2-201ENST00000247020 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.877e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 PIGG-203ENST00000453061 3218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.43□□□□□ -0.97e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 ASPH-205ENST00000445642 3717 ntTSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.917e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 AP1G2-207ENST00000553685 561 ntTSL 1 (best)9.23□□□□□ -0.937e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 COG7-201ENST00000307149 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.19□□□□□ -0.947e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 PIGG-201ENST00000310340 3203 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.14□□□□□ -0.957e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 PDXK-217ENST00000490666 577 ntTSL 59.09□□□□□ -0.951e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 ASPH-201ENST00000356457 3730 ntTSL 1 (best) BASIC9□□□□□ -0.977e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 MNAT1-201ENST00000261245 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.94□□□□□ -0.987e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 MNAT1-208ENST00000556764 1097 ntTSL 1 (best)8.8□□□□□ -17e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 PDXK-203ENST00000343528 1101 ntTSL 1 (best)8.78□□□□□ -11e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 AP1G2-226ENST00000556843 562 ntTSL 48.71□□□□□ -1.027e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC8.57□□□□□ -1.047e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 AP1G2-208ENST00000553756 656 ntTSL 38.5□□□□□ -1.057e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC8.45□□□□□ -1.067e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 AK2-215ENST00000629371 3576 ntTSL 3 BASIC8.39□□□□□ -1.077e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 AK2-206ENST00000480134 811 ntTSL 2 BASIC8.34□□□□□ -1.077e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 AK2-212ENST00000550338 886 ntTSL 28.34□□□□□ -1.077e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC8.28□□□□□ -1.087e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 MNAT1-206ENST00000555545 612 ntTSL 38.14□□□□□ -1.117e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 AK2-202ENST00000373449 3586 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.95□□□□□ -1.147e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 PIGG-215ENST00000508562 570 ntTSL 47.88□□□□□ -1.157e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 CTDSPL-201ENST00000273179 4459 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.52□□□□□ -1.217e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 MNAT1-203ENST00000553354 277 ntTSL 27.33□□□□□ -1.247e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 MNAT1-202ENST00000539616 1220 ntTSL 1 (best) BASIC7.27□□□□□ -1.257e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 ASPH-230ENST00000541428 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC6.79□□□□□ -1.327e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 SDF2-209ENST00000591903 735 ntTSL 36.29□□□□□ -1.47e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 ASPH-209ENST00000517903 2658 ntTSL 1 (best) BASIC6.27□□□□□ -1.417e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 LINC01146-204ENST00000556033 833 ntTSL 1 (best) BASIC6.06□□□□□ -1.447e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 AK2-211ENST00000548559 530 ntTSL 45.8□□□□□ -1.487e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 ASPH-225ENST00000522835 1258 ntTSL 2 BASIC5.69□□□□□ -1.57e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 SDF2-203ENST00000585749 823 ntTSL 35.67□□□□□ -1.57e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 SDF2-207ENST00000588472 681 ntTSL 25.44□□□□□ -1.547e-6■■■■□ 19.5
SRSF9Q13242 SDF2-204ENST00000587338 583 ntTSL 35.29□□□□□ -1.567e-6■■■■□ 19.5
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