RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489895.5

NISCH-213, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 2

Gene NISCH, Length 5,350 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-213ENST00000489895 DCAF8L2P0C7V8 631 aa29.94■■■□□ 2.38
NISCH-213ENST00000489895 NISCHQ9Y2I1 1504 aa29.45■■■□□ 2.31
NISCH-213ENST00000489895 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP28.26■■■□□ 2.11
NISCH-213ENST00000489895 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa27.87■■■□□ 2.05
NISCH-213ENST00000489895 EHMT2Q96KQ7 1210 aa26.98■■□□□ 1.91
NISCH-213ENST00000489895 APLP2Q06481 763 aa26.94■■□□□ 1.9
NISCH-213ENST00000489895 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP26.78■■□□□ 1.88
NISCH-213ENST00000489895 TRIM41Q8WV44 630 aa26.37■■□□□ 1.81
NISCH-213ENST00000489895 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP26.27■■□□□ 1.8
NISCH-213ENST00000489895 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP26.06■■□□□ 1.76
NISCH-213ENST00000489895 PCGF6Q9BYE7 350 aa26.02■■□□□ 1.76
NISCH-213ENST00000489895 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP26.02■■□□□ 1.76
NISCH-213ENST00000489895 UBTFP17480 764 aaKnown RBP26■■□□□ 1.75
NISCH-213ENST00000489895 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
NISCH-213ENST00000489895 ATP1B4Q9UN42 357 aaPredicted RBP25.92■■□□□ 1.74
NISCH-213ENST00000489895 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP25.73■■□□□ 1.71
NISCH-213ENST00000489895 CENPBP07199 599 aaPredicted RBP25.5■■□□□ 1.67
NISCH-213ENST00000489895 ABCC9O60706 1549 aa25.31■■□□□ 1.64
NISCH-213ENST00000489895 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP25.26■■□□□ 1.63
NISCH-213ENST00000489895 CHIC1Q5VXU3 224 aa25.21■■□□□ 1.63
NISCH-213ENST00000489895 HNRNPUL2-BSCL2H3BQZ7 746 aaPredicted RBP25.16■■□□□ 1.62
NISCH-213ENST00000489895 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP25.16■■□□□ 1.62
NISCH-213ENST00000489895 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP25.14■■□□□ 1.61
NISCH-213ENST00000489895 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP25.05■■□□□ 1.61e-10■■■■□ 21.1
NISCH-213ENST00000489895 MYT1LQ9UL68 1186 aa25.01■■□□□ 1.59
NISCH-213ENST00000489895 NEFLP07196 543 aa24.99■■□□□ 1.59
NISCH-213ENST00000489895 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa24.97■■□□□ 1.59
NISCH-213ENST00000489895 ITGAEP38570 1179 aa24.94■■□□□ 1.58
NISCH-213ENST00000489895 ERICH6Q7L0X2 663 aa24.93■■□□□ 1.58
NISCH-213ENST00000489895 HRCP23327 699 aa24.76■■□□□ 1.55
NISCH-213ENST00000489895 YTHDC1Q96MU7 727 aaKnown RBP24.75■■□□□ 1.55
NISCH-213ENST00000489895 POLR3GLQ9BT43 218 aa24.59■■□□□ 1.53
NISCH-213ENST00000489895 FAM50AQ14320 339 aaKnown RBP24.5■■□□□ 1.51
NISCH-213ENST00000489895 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP24.37■■□□□ 1.49
NISCH-213ENST00000489895 TRIM52Q96A61 297 aa24.35■■□□□ 1.49
NISCH-213ENST00000489895 FBLN2P98095 1184 aa24.34■■□□□ 1.49
NISCH-213ENST00000489895 SCRIBQ14160 1630 aa24.32■■□□□ 1.48
NISCH-213ENST00000489895 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa24.32■■□□□ 1.48
NISCH-213ENST00000489895 CSRNP3Q8WYN3 585 aa24.28■■□□□ 1.48
NISCH-213ENST00000489895 SLC4A1APQ9BWU0 796 aaKnown RBP24.23■■□□□ 1.47
NISCH-213ENST00000489895 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
NISCH-213ENST00000489895 DAXXQ9UER7 740 aaPredicted RBP24.16■■□□□ 1.46
NISCH-213ENST00000489895 MYT1Q01538 1121 aa24.14■■□□□ 1.46
NISCH-213ENST00000489895 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP24.14■■□□□ 1.45
NISCH-213ENST00000489895 NEUROD1Q13562 356 aa24.1■■□□□ 1.45
NISCH-213ENST00000489895 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP24.06■■□□□ 1.44
NISCH-213ENST00000489895 P3H3Q8IVL6 736 aa24.01■■□□□ 1.43
NISCH-213ENST00000489895 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa23.93■■□□□ 1.42
NISCH-213ENST00000489895 ZNF326Q5BKZ1 582 aaKnown RBP23.91■■□□□ 1.42
NISCH-213ENST00000489895 ANP32CO43423 234 aa23.87■■□□□ 1.41
NISCH-213ENST00000489895 ARID3CA6NKF2 412 aa23.83■■□□□ 1.41
NISCH-213ENST00000489895 ZNF777Q9ULD5 760 aaPredicted RBP23.8■■□□□ 1.4
NISCH-213ENST00000489895 CLSPNQ9HAW4 1339 aa23.76■■□□□ 1.39
NISCH-213ENST00000489895 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP23.75■■□□□ 1.39
NISCH-213ENST00000489895 NACADO15069 1562 aa23.72■■□□□ 1.39
NISCH-213ENST00000489895 NPM1P06748 294 aaKnown RBP eCLIP23.72■■□□□ 1.39
NISCH-213ENST00000489895 BCANQ96GW7 911 aa23.65■■□□□ 1.38
NISCH-213ENST00000489895 ESF1Q9H501 851 aaKnown RBP23.63■■□□□ 1.37
NISCH-213ENST00000489895 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa23.62■■□□□ 1.37
NISCH-213ENST00000489895 NEFMP07197 916 aa23.6■■□□□ 1.37
NISCH-213ENST00000489895 ZBTB47Q9UFB7 747 aaPredicted RBP23.53■■□□□ 1.36
NISCH-213ENST00000489895 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP23.52■■□□□ 1.36
NISCH-213ENST00000489895 TONSLQ96HA7 1378 aa23.52■■□□□ 1.36
NISCH-213ENST00000489895 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP23.5■■□□□ 1.35
NISCH-213ENST00000489895 EEA1Q15075 1411 aa23.5■■□□□ 1.35
NISCH-213ENST00000489895 RTL5Q5HYW3 569 aaPredicted RBP23.46■■□□□ 1.35
NISCH-213ENST00000489895 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP23.43■■□□□ 1.34
NISCH-213ENST00000489895 STAG3Q9UJ98 1225 aa23.43■■□□□ 1.34
NISCH-213ENST00000489895 MTUS2Q5JR59 1369 aa23.43■■□□□ 1.34
NISCH-213ENST00000489895 TSPY4P0CV99 314 aa23.42■■□□□ 1.34
NISCH-213ENST00000489895 TSPY10P0CW01 314 aa23.42■■□□□ 1.34
NISCH-213ENST00000489895 CANXP27824 592 aaKnown RBP23.41■■□□□ 1.34
NISCH-213ENST00000489895 CLIP1P30622 1438 aa23.39■■□□□ 1.34
NISCH-213ENST00000489895 CHGAP10645 457 aaKnown RBP23.38■■□□□ 1.33
NISCH-213ENST00000489895 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa23.37■■□□□ 1.33
NISCH-213ENST00000489895 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP23.33■■□□□ 1.32
NISCH-213ENST00000489895 SLC24A1O60721 1099 aa23.32■■□□□ 1.32
NISCH-213ENST00000489895 CHIC2Q9UKJ5 165 aa23.31■■□□□ 1.32
NISCH-213ENST00000489895 GOLGA3Q08378 1498 aa23.31■■□□□ 1.32
NISCH-213ENST00000489895 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP23.28■■□□□ 1.32
NISCH-213ENST00000489895 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP23.27■■□□□ 1.32
NISCH-213ENST00000489895 KIF27Q86VH2 1401 aa23.25■■□□□ 1.31
NISCH-213ENST00000489895 GRWD1Q9BQ67 446 aaKnown RBP eCLIP23.25■■□□□ 1.312e-6■□□□□ 9.1
NISCH-213ENST00000489895 PLEKHD1A6NEE1 506 aa23.21■■□□□ 1.31
NISCH-213ENST00000489895 CEP162Q5TB80 1403 aa23.13■■□□□ 1.29
NISCH-213ENST00000489895 CEP164Q9UPV0 1460 aa23.12■■□□□ 1.29
NISCH-213ENST00000489895 DDX10Q13206 875 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
NISCH-213ENST00000489895 TNIKQ9UKE5 1360 aa23.08■■□□□ 1.29
NISCH-213ENST00000489895 PLPPR3Q6T4P5 718 aa23.05■■□□□ 1.28
NISCH-213ENST00000489895 ERCC6Q03468 1493 aa23.04■■□□□ 1.28
NISCH-213ENST00000489895 KCNH8Q96L42 1107 aa23.04■■□□□ 1.28
NISCH-213ENST00000489895 KDM2AQ9Y2K7 1162 aa23.02■■□□□ 1.28
NISCH-213ENST00000489895 TMC1Q8TDI8 760 aa23.01■■□□□ 1.27
NISCH-213ENST00000489895 HNRNPUQ00839 825 aaKnown RBP eCLIP23.01■■□□□ 1.27
NISCH-213ENST00000489895 RRP7BPQ9NSQ0 103 aa23■■□□□ 1.27
NISCH-213ENST00000489895 FAM9BQ8IZU0 186 aa22.98■■□□□ 1.27
NISCH-213ENST00000489895 BCL11AQ9H165 835 aa22.97■■□□□ 1.27
NISCH-213ENST00000489895 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP22.97■■□□□ 1.27
NISCH-213ENST00000489895 CECR2Q9BXF3 1484 aa22.96■■□□□ 1.27
NISCH-213ENST00000489895 ANP32AP39687 249 aaKnown RBP22.96■■□□□ 1.27
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