RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000488380.5

NISCH-212, Transcript of nischarin, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene NISCH, Length 3,168 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-212ENST00000488380 NISCHQ9Y2I1 1504 aa27.52■■■□□ 2
NISCH-212ENST00000488380 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa23.6■■□□□ 1.37
NISCH-212ENST00000488380 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa23.36■■□□□ 1.33
NISCH-212ENST00000488380 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP23.26■■□□□ 1.31
NISCH-212ENST00000488380 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
NISCH-212ENST00000488380 DCAF8L2P0C7V8 631 aa23■■□□□ 1.27
NISCH-212ENST00000488380 HRCP23327 699 aa22.56■■□□□ 1.2
NISCH-212ENST00000488380 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa22.47■■□□□ 1.19
NISCH-212ENST00000488380 CHIC1Q5VXU3 224 aa22.32■■□□□ 1.16
NISCH-212ENST00000488380 MYO15BQ96JP2 1530 aa22.3■■□□□ 1.16
NISCH-212ENST00000488380 PCGF6Q9BYE7 350 aa22.28■■□□□ 1.16
NISCH-212ENST00000488380 PPARGC1BQ86YN6 1023 aaKnown RBP22.24■■□□□ 1.15
NISCH-212ENST00000488380 SCRIBQ14160 1630 aa22.04■■□□□ 1.12
NISCH-212ENST00000488380 ABCC9O60706 1549 aa21.94■■□□□ 1.1
NISCH-212ENST00000488380 PELP1Q8IZL8 1130 aaKnown RBP21.8■■□□□ 1.08
NISCH-212ENST00000488380 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP21.78■■□□□ 1.08
NISCH-212ENST00000488380 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa21.75■■□□□ 1.07
NISCH-212ENST00000488380 NACADO15069 1562 aa21.62■■□□□ 1.05
NISCH-212ENST00000488380 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa21.6■■□□□ 1.05
NISCH-212ENST00000488380 CECR2Q9BXF3 1484 aa21.57■■□□□ 1.04
NISCH-212ENST00000488380 MROH2BQ7Z745 1585 aa21.46■■□□□ 1.03
NISCH-212ENST00000488380 TRIM26Q12899 539 aaPredicted RBP21.42■■□□□ 1.02
NISCH-212ENST00000488380 TRIM41Q8WV44 630 aa21.4■■□□□ 1.02
NISCH-212ENST00000488380 SCAF1Q9H7N4 1312 aaKnown RBP21.39■■□□□ 1.02
NISCH-212ENST00000488380 WIZO95785 1651 aa21.36■■□□□ 1.01
NISCH-212ENST00000488380 FAM9AQ8IZU1 332 aaPredicted RBP21.35■■□□□ 1.01
NISCH-212ENST00000488380 EHMT2Q96KQ7 1210 aa21.26■□□□□ 0.99
NISCH-212ENST00000488380 ZEB1P37275 1124 aaPredicted RBP21.23■□□□□ 0.99
NISCH-212ENST00000488380 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP21.13■□□□□ 0.97
NISCH-212ENST00000488380 UNC13AQ9UPW8 1703 aa21.11■□□□□ 0.97
NISCH-212ENST00000488380 SMARCA4P51532 1647 aa20.99■□□□□ 0.95
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NISCH-212ENST00000488380 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP20.96■□□□□ 0.95
NISCH-212ENST00000488380 MYT1Q01538 1121 aa20.93■□□□□ 0.94
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NISCH-212ENST00000488380 CCDC88BA6NC98 1476 aa20.9■□□□□ 0.94
NISCH-212ENST00000488380 ABCC8Q09428 1581 aa20.89■□□□□ 0.93
NISCH-212ENST00000488380 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP20.87■□□□□ 0.93
NISCH-212ENST00000488380 SMARCA2P51531 1590 aa20.85■□□□□ 0.93
NISCH-212ENST00000488380 NEUROD1Q13562 356 aa20.85■□□□□ 0.93
NISCH-212ENST00000488380 BICRAQ9NZM4 1560 aa20.82■□□□□ 0.92
NISCH-212ENST00000488380 GTF3C3Q9Y5Q9 886 aa20.8■□□□□ 0.92
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NISCH-212ENST00000488380 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa20.6■□□□□ 0.89
NISCH-212ENST00000488380 DIEXFQ68CQ4 756 aaKnown RBP20.58■□□□□ 0.89
NISCH-212ENST00000488380 TTBK1Q5TCY1 1321 aaPredicted RBP20.53■□□□□ 0.88
NISCH-212ENST00000488380 PEG3Q9GZU2 1588 aa20.52■□□□□ 0.88
NISCH-212ENST00000488380 CEP162Q5TB80 1403 aa20.47■□□□□ 0.87
NISCH-212ENST00000488380 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa20.47■□□□□ 0.87
NISCH-212ENST00000488380 CSRNP3Q8WYN3 585 aa20.46■□□□□ 0.87
NISCH-212ENST00000488380 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP20.45■□□□□ 0.86
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NISCH-212ENST00000488380 SYNJ1O43426 1573 aa20.41■□□□□ 0.86
NISCH-212ENST00000488380 TNIKQ9UKE5 1360 aa20.38■□□□□ 0.85
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NISCH-212ENST00000488380 CEP164Q9UPV0 1460 aa20.17■□□□□ 0.82
NISCH-212ENST00000488380 RANGAP1P46060 587 aaPredicted RBP20.17■□□□□ 0.82
NISCH-212ENST00000488380 KIF21BO75037 1637 aa20.14■□□□□ 0.82
NISCH-212ENST00000488380 RAPGEF2Q9Y4G8 1499 aa20.14■□□□□ 0.81
NISCH-212ENST00000488380 ZNF316A6NFI3 1004 aaPredicted RBP20.12■□□□□ 0.81
NISCH-212ENST00000488380 CLIP1P30622 1438 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-212ENST00000488380 TOP2BQ02880 1626 aa20.09■□□□□ 0.81
NISCH-212ENST00000488380 NCAPD3P42695 1498 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-212ENST00000488380 MIER1Q8N108 512 aa20.03■□□□□ 0.8
NISCH-212ENST00000488380 HMGXB3Q12766 1538 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-212ENST00000488380 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa20.01■□□□□ 0.79
NISCH-212ENST00000488380 HNRNPUL2Q1KMD3 747 aaKnown RBP19.97■□□□□ 0.79
NISCH-212ENST00000488380 VPS8Q8N3P4 1428 aa19.97■□□□□ 0.79
NISCH-212ENST00000488380 CUX1P39880 1505 aa19.97■□□□□ 0.79
NISCH-212ENST00000488380 CFTRP13569 1480 aa19.88■□□□□ 0.77
NISCH-212ENST00000488380 PRXQ9BXM0 1461 aa19.88■□□□□ 0.77
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NISCH-212ENST00000488380 ERICH3Q5RHP9 1530 aa19.82■□□□□ 0.76
NISCH-212ENST00000488380 ARAP1Q96P48 1450 aa19.81■□□□□ 0.76
NISCH-212ENST00000488380 KIF27Q86VH2 1401 aa19.79■□□□□ 0.76
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NISCH-212ENST00000488380 CADPSQ9ULU8 1353 aa19.68■□□□□ 0.74
NISCH-212ENST00000488380 CUX2O14529 1486 aa19.68■□□□□ 0.74
NISCH-212ENST00000488380 BCL11AQ9H165 835 aa19.68■□□□□ 0.74
NISCH-212ENST00000488380 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa19.65■□□□□ 0.74
NISCH-212ENST00000488380 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa19.64■□□□□ 0.74
NISCH-212ENST00000488380 IGF1RP08069 1367 aa19.63■□□□□ 0.73
NISCH-212ENST00000488380 FGD5Q6ZNL6 1462 aa19.62■□□□□ 0.73
NISCH-212ENST00000488380 TSHZ2Q9NRE2 1034 aa19.61■□□□□ 0.73
NISCH-212ENST00000488380 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-212ENST00000488380 CLSPNQ9HAW4 1339 aa19.53■□□□□ 0.72
NISCH-212ENST00000488380 FANCD2Q9BXW9 1451 aa19.52■□□□□ 0.72
NISCH-212ENST00000488380 NESP48681 1621 aa19.51■□□□□ 0.71
NISCH-212ENST00000488380 ITGAEP38570 1179 aa19.5■□□□□ 0.71
NISCH-212ENST00000488380 DHX57Q6P158 1386 aaKnown RBP19.5■□□□□ 0.71
NISCH-212ENST00000488380 BCANQ96GW7 911 aa19.49■□□□□ 0.71
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