RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485765.5

NISCH-209, Transcript of nischarin, humanhuman

TSL 4

Gene NISCH, Length 563 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NISCH-209ENST00000485765 NISCHQ9Y2I1 1504 aa46.54■■■■■ 5.04
NISCH-209ENST00000485765 CCDC180Q9P1Z9 1646 aa41.36■■■■■ 4.21
NISCH-209ENST00000485765 ABCC9O60706 1549 aa40.64■■■■■ 4.1
NISCH-209ENST00000485765 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa39.03■■■■□ 3.84
NISCH-209ENST00000485765 NACADO15069 1562 aa38.99■■■■□ 3.83
NISCH-209ENST00000485765 DCAF8L2P0C7V8 631 aa38.92■■■■□ 3.82
NISCH-209ENST00000485765 MYO15BQ96JP2 1530 aa38.77■■■■□ 3.8
NISCH-209ENST00000485765 ZCCHC6Q5VYS8 1495 aaKnown RBP38.73■■■■□ 3.79
NISCH-209ENST00000485765 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa38.53■■■■□ 3.76
NISCH-209ENST00000485765 UNC13AQ9UPW8 1703 aa38.08■■■■□ 3.69
NISCH-209ENST00000485765 PABPN1Q86U42 306 aaKnown RBP eCLIP38.01■■■■□ 3.68
NISCH-209ENST00000485765 BICRAQ9NZM4 1560 aa37.9■■■■□ 3.66
NISCH-209ENST00000485765 SCRIBQ14160 1630 aa37.7■■■■□ 3.63
NISCH-209ENST00000485765 DNAJC5BQ9UF47 199 aa37.58■■■■□ 3.61
NISCH-209ENST00000485765 SHROOM4Q9ULL8 1493 aa37.49■■■■□ 3.59
NISCH-209ENST00000485765 EIF4G1Q04637 1599 aaKnown RBP36.87■■■■□ 3.49
NISCH-209ENST00000485765 CC2D2AQ9P2K1 1620 aa36.75■■■■□ 3.47
NISCH-209ENST00000485765 CECR2Q9BXF3 1484 aa36.56■■■■□ 3.44
NISCH-209ENST00000485765 SMARCA4P51532 1647 aa36.09■■■■□ 3.37
NISCH-209ENST00000485765 BAZ1AQ9NRL2 1556 aaPredicted RBP36.05■■■■□ 3.36
NISCH-209ENST00000485765 NCAPD3P42695 1498 aa36.04■■■■□ 3.36
NISCH-209ENST00000485765 ATAD2BQ9ULI0 1458 aa36■■■■□ 3.35
NISCH-209ENST00000485765 SMARCA2P51531 1590 aa35.91■■■■□ 3.34
NISCH-209ENST00000485765 MROH2BQ7Z745 1585 aa35.86■■■■□ 3.33
NISCH-209ENST00000485765 PEG3Q9GZU2 1588 aa35.81■■■■□ 3.32
NISCH-209ENST00000485765 HMGXB3Q12766 1538 aa35.77■■■■□ 3.32
NISCH-209ENST00000485765 BAZ1BQ9UIG0 1483 aaKnown RBP35.64■■■■□ 3.3
NISCH-209ENST00000485765 RSF1Q96T23 1441 aaPredicted RBP35.44■■■■□ 3.26
NISCH-209ENST00000485765 WIZO95785 1651 aa35.41■■■■□ 3.26
NISCH-209ENST00000485765 NESP48681 1621 aa35.15■■■■□ 3.22
NISCH-209ENST00000485765 TOP2AP11388 1531 aaKnown RBP35.05■■■■□ 3.2
NISCH-209ENST00000485765 LAMC3Q9Y6N6 1575 aa35.03■■■■□ 3.2
NISCH-209ENST00000485765 ERCC6Q03468 1493 aa35.02■■■■□ 3.2
NISCH-209ENST00000485765 CADPSQ9ULU8 1353 aa34.97■■■■□ 3.19
NISCH-209ENST00000485765 PDS5BQ9NTI5 1447 aa34.84■■■■□ 3.17
NISCH-209ENST00000485765 CUX2O14529 1486 aa34.76■■■■□ 3.15
NISCH-209ENST00000485765 CFTRP13569 1480 aa34.72■■■■□ 3.15
NISCH-209ENST00000485765 CCDC88BA6NC98 1476 aa34.69■■■■□ 3.14
NISCH-209ENST00000485765 KIF21AQ7Z4S6 1674 aa34.65■■■■□ 3.14
NISCH-209ENST00000485765 THOC2Q8NI27 1593 aaKnown RBP34.61■■■■□ 3.13
NISCH-209ENST00000485765 FANCD2Q9BXW9 1451 aa34.52■■■■□ 3.12
NISCH-209ENST00000485765 MRC2Q9UBG0 1479 aa34.46■■■■□ 3.11
NISCH-209ENST00000485765 CEP164Q9UPV0 1460 aa34.46■■■■□ 3.11
NISCH-209ENST00000485765 SUPT5HO00267 1087 aaKnown RBP34.38■■■■□ 3.09
NISCH-209ENST00000485765 WDR62O43379 1518 aa34.35■■■■□ 3.09
NISCH-209ENST00000485765 PRDM2Q13029 1718 aa34.28■■■■□ 3.08
NISCH-209ENST00000485765 URB2Q14146 1524 aaKnown RBP34.19■■■■□ 3.06
NISCH-209ENST00000485765 DNAJC5Q9H3Z4 198 aa33.96■■■■□ 3.03
NISCH-209ENST00000485765 ABCC8Q09428 1581 aa33.96■■■■□ 3.03
NISCH-209ENST00000485765 TOPBP1Q92547 1522 aa33.94■■■■□ 3.02
NISCH-209ENST00000485765 DNMBPQ6XZF7 1577 aa33.87■■■■□ 3.01
NISCH-209ENST00000485765 IFT140Q96RY7 1462 aa33.78■■■■□ 3
NISCH-209ENST00000485765 POLA1P09884 1462 aaPredicted RBP33.65■■■□□ 2.98
NISCH-209ENST00000485765 CUX1P39880 1505 aa33.63■■■□□ 2.97
NISCH-209ENST00000485765 ZNF608Q9ULD9 1512 aaPredicted RBP33.63■■■□□ 2.97
NISCH-209ENST00000485765 TARBP1Q13395 1621 aaKnown RBP33.58■■■□□ 2.97
NISCH-209ENST00000485765 SOGA1O94964 1423 aa33.54■■■□□ 2.96
NISCH-209ENST00000485765 FGD5Q6ZNL6 1462 aa33.53■■■□□ 2.96
NISCH-209ENST00000485765 RAD54L2Q9Y4B4 1467 aa33.51■■■□□ 2.96
NISCH-209ENST00000485765 AQRO60306 1485 aaKnown RBP eCLIP33.44■■■□□ 2.941e-11■□□□□ 10
NISCH-209ENST00000485765 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP33.43■■■□□ 2.94
NISCH-209ENST00000485765 WRNQ14191 1432 aaPredicted RBP eCLIP33.37■■■□□ 2.93
NISCH-209ENST00000485765 TDRD9Q8NDG6 1382 aaKnown RBP33.36■■■□□ 2.93
NISCH-209ENST00000485765 OSCARQ8IYS5 282 aa33.35■■■□□ 2.93
NISCH-209ENST00000485765 WDR97A6NE52 1622 aa33.3■■■□□ 2.92
NISCH-209ENST00000485765 TOP2BQ02880 1626 aa33.29■■■□□ 2.92
NISCH-209ENST00000485765 BIVM-ERCC5R4GMW8 1640 aa33.27■■■□□ 2.92
NISCH-209ENST00000485765 SYNJ1O43426 1573 aa33.26■■■□□ 2.91
NISCH-209ENST00000485765 ABCA10Q8WWZ4 1543 aa33.23■■■□□ 2.91
NISCH-209ENST00000485765 GRIN2BQ13224 1484 aa33.14■■■□□ 2.9
NISCH-209ENST00000485765 GAPVD1Q14C86 1478 aa33.12■■■□□ 2.89
NISCH-209ENST00000485765 SNAPC4Q5SXM2 1469 aa33.08■■■□□ 2.89
NISCH-209ENST00000485765 MAGI1Q96QZ7 1491 aaPredicted RBP33.06■■■□□ 2.88
NISCH-209ENST00000485765 ABCA5Q8WWZ7 1642 aa33.06■■■□□ 2.88
NISCH-209ENST00000485765 FBLN2P98095 1184 aa33.04■■■□□ 2.88
NISCH-209ENST00000485765 CHD1O14646 1710 aa32.99■■■□□ 2.87
NISCH-209ENST00000485765 CHMP7Q8WUX9 453 aaPredicted RBP32.97■■■□□ 2.87
NISCH-209ENST00000485765 PBRM1Q86U86 1689 aa32.95■■■□□ 2.87
NISCH-209ENST00000485765 SYNJ2O15056 1496 aa32.94■■■□□ 2.86
NISCH-209ENST00000485765 ERICH3Q5RHP9 1530 aa32.82■■■□□ 2.85
NISCH-209ENST00000485765 FHAD1B1AJZ9 1412 aa32.76■■■□□ 2.83
NISCH-209ENST00000485765 ADAMTS12P58397 1594 aa32.74■■■□□ 2.83
NISCH-209ENST00000485765 ARHGEF11O15085 1522 aa32.73■■■□□ 2.83
NISCH-209ENST00000485765 CLASP1Q7Z460 1538 aa32.73■■■□□ 2.83
NISCH-209ENST00000485765 RIMBP3CA6NJZ7 1639 aa32.73■■■□□ 2.83
NISCH-209ENST00000485765 RIMBP3BA6NNM3 1639 aa32.73■■■□□ 2.83
NISCH-209ENST00000485765 RIMBP3Q9UFD9 1639 aa32.73■■■□□ 2.83
NISCH-209ENST00000485765 GRIN2AQ12879 1464 aa32.7■■■□□ 2.83
NISCH-209ENST00000485765 KIF27Q86VH2 1401 aa32.68■■■□□ 2.82
NISCH-209ENST00000485765 TRIM41Q8WV44 630 aa32.66■■■□□ 2.82
NISCH-209ENST00000485765 IGF1RP08069 1367 aa32.66■■■□□ 2.82
NISCH-209ENST00000485765 NUP160Q12769 1436 aa32.6■■■□□ 2.81
NISCH-209ENST00000485765 CEP170Q5SW79 1584 aa32.53■■■□□ 2.8
NISCH-209ENST00000485765 CYB5RLQ6IPT4 315 aa32.49■■■□□ 2.79
NISCH-209ENST00000485765 ARAP1Q96P48 1450 aa32.48■■■□□ 2.79
NISCH-209ENST00000485765 CUL7Q14999 1698 aa32.43■■■□□ 2.78
NISCH-209ENST00000485765 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa32.42■■■□□ 2.78
NISCH-209ENST00000485765 RUSC2Q8N2Y8 1516 aa32.36■■■□□ 2.77
NISCH-209ENST00000485765 SHROOM2Q13796 1616 aa32.33■■■□□ 2.77
NISCH-209ENST00000485765 JPH4Q96JJ6 628 aa32.31■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 77.6 ms