Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
ERCC8Q13216 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
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ERCC8Q13216 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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ERCC8Q13216 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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ERCC8Q13216 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ERCC8Q13216 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
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ERCC8Q13216 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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ERCC8Q13216 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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ERCC8Q13216 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
ERCC8Q13216 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
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ERCC8Q13216 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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ERCC8Q13216 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
ERCC8Q13216 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
ERCC8Q13216 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
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