Protein–RNA interactions for Protein: Q13156

RPA4, Replication protein A 30 kDa subunit, humanhuman

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Length 261 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPA4Q13156 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
RPA4Q13156 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
RPA4Q13156 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
RPA4Q13156 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
RPA4Q13156 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
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