Protein–RNA interactions for Protein: Q13103

SPP2, Secreted phosphoprotein 24, humanhuman

Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPP2Q13103 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPP2Q13103 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SPP2Q13103 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPP2Q13103 TMEM120A-214ENST00000493111 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SPP2Q13103 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPP2Q13103 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SPP2Q13103 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 HSPB6-202ENST00000587965 711 ntTSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.03■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC29.02■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
SPP2Q13103 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC29.01■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC29.01■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 FAM120C-203ENST00000477084 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC29■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.95■■■□□ 2.23
SPP2Q13103 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC28.95■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC28.94■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC28.92■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC28.91■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SPP2Q13103 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 RASGEF1B-211ENST00000514050 537 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
SPP2Q13103 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 204.7 ms