Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC32.25■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
SOS1Q07889 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC32.2■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.17■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
SOS1Q07889 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC32.12■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.09■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC32.09■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
SOS1Q07889 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC32.07■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.05■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC32.04■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
SOS1Q07889 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
SOS1Q07889 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
SOS1Q07889 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
SOS1Q07889 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
SOS1Q07889 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SOS1Q07889 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SOS1Q07889 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
SOS1Q07889 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC32■■■□□ 2.71
SOS1Q07889 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms