Protein–RNA interactions for Protein: Q06609

RAD51, DNA repair protein RAD51 homolog 1, humanhuman

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD51Q06609 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
RAD51Q06609 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
RAD51Q06609 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
RAD51Q06609 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC25■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.95■■□□□ 1.59
RAD51Q06609 RFFL-206ENST00000447669 2030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
RAD51Q06609 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.8 ms