Protein–RNA interactions for Protein: P61353

RPL27, 60S ribosomal protein L27, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL27P61353 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL27P61353 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL27P61353 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
RPL27P61353 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL27P61353 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL27P61353 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL27P61353 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL27P61353 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL27P61353 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL27P61353 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL27P61353 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL27P61353 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
RPL27P61353 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL27P61353 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL27P61353 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
RPL27P61353 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL27P61353 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL27P61353 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
RPL27P61353 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL27P61353 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
RPL27P61353 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL27P61353 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL27P61353 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL27P61353 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL27P61353 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL27P61353 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL27P61353 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL27P61353 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL27P61353 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL27P61353 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
RPL27P61353 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL27P61353 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL27P61353 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL27P61353 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL27P61353 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL27P61353 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL27P61353 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
RPL27P61353 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL27P61353 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL27P61353 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL27P61353 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
RPL27P61353 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL27P61353 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL27P61353 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL27P61353 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL27P61353 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL27P61353 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL27P61353 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
RPL27P61353 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL27P61353 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL27P61353 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
RPL27P61353 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL27P61353 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL27P61353 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL27P61353 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RPL27P61353 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL27P61353 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL27P61353 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL27P61353 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RPL27P61353 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL27P61353 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL27P61353 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RPL27P61353 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL27P61353 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RPL27P61353 TP53I3-201ENST00000238721 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL27P61353 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL27P61353 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL27P61353 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL27P61353 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL27P61353 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL27P61353 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL27P61353 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL27P61353 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL27P61353 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RPL27P61353 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL27P61353 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL27P61353 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL27P61353 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL27P61353 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL27P61353 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL27P61353 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL27P61353 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
RPL27P61353 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL27P61353 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL27P61353 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL27P61353 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
RPL27P61353 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL27P61353 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL27P61353 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL27P61353 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL27P61353 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL27P61353 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
RPL27P61353 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
RPL27P61353 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL27P61353 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL27P61353 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL27P61353 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL27P61353 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL27P61353 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
RPL27P61353 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms